云的彼端，约定的地方

故事发生在1996年，一个平行的战后时期，当时日本处于分裂状态。北海道由“联邦”统治，而本州和其他南部岛屿则由美国统治。北海道上建起了一座高塔，甚至从东京都能看到。1996年夏天，三名中学生约定驾驶一架自制飞机跨越国境，解开这座塔的秘密。然而，随着少女泽渡小百合神秘患病并被转移到东京，他们的计划被迫搁置。多年后，在另一场战争即将爆发之际，藤泽弘树发现小百合自此一直处于昏迷状态，于是他请求白川卓也帮忙寻找唤醒她的方法。